Tag: pipeline

ต่อจาก สร้าง Hadoop และ Spark Cluster เพื่องานด้าน Data Science ด้วย Google Cloud Dataproc + Datalab

1. จาก Google Cloud Datalab คลิก Notebookแล้ว ตั้งชื่อ Demo01
   
   เลือได้ว่า จะใช้ Python2 หรือ Python3 ในที่นี้จะเลือก Python3
   
2. ตรวจสอบรุ่นของ Spark ที่ใช้งานด้วยคำสั่ง

   spark.version

   แล้วกดปุ่ม Shift+Enter เพื่อ Run
   

3. สามารถใช้คำสั่งไปย้ง Shell ซึ่งเป็น Linux ได้ โดยใช้เครื่องหมาย ! นำหน้า
   ในที่นี้ จะ Download iris dataset จาก https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data มาไว้ในเครื่อง mycluster-m ด้วย คำสั่ง

   ! wget https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data

   แล้ว เอาไปใส่ใน HDFS ด้วยคำสั่ง

   ! hdfs dfs -put iris.data /

   จะได้ผลประมาณนี้
   

4. จาก Machine Learning #01 – Python with iris dataset ซึ่งเดิมใช้ sklearn จะเปลี่ยนเป็น Spark MLlib เพื่อใช้ความสามารถของ Spark Cluster ได้ เริ่มต้นจาก Import Library ที่จำเป็นดังนี้

   # Import Libaries
   from pyspark.ml import Pipeline
   from pyspark.ml.evaluation import MulticlassClassificationEvaluator
   from pyspark.ml.classification import LogisticRegression
   from pyspark.ml.tuning import ParamGridBuilder, CrossValidator
   from pyspark.ml.feature import VectorAssembler
   from pyspark.sql.types import *

5. จากนั้น สร้าง Spark Dataframe (Concept จะคล้ายกับ Pandas แต่มีรายละเอียดที่มากกว่า)

   # get into DataFrame
   csvFile = spark.read.csv('/iris.data', inferSchema=True)
   diz = {"Iris-setosa":"1", "Iris-versicolor":"2", "Iris-virginica":"3" }
   df = csvFile.na.replace(diz,1,"_c4")
   df2 = df.withColumn("label",df["_c4"].cast(IntegerType())) \
   .withColumnRenamed("_c0","sepal_length") \
   .withColumnRenamed("_c1","sepal_width") \
   .withColumnRenamed("_c2","petal_length") \
   .withColumnRenamed("_c3","petal_width") 
   train,test = df2.randomSplit([0.75,0.25])

   เริ่มจาก ให้ spark session (spark) อ่านไฟล์ CSV จาก HDFS /iris.data โดยระบุว่า ให้กำหนด Data Type อัตโนมัติ (inforSchema=True) และไฟล์นี้ไม่มี Header

   Dataset นี้ ประกอบด้วย 5 columns เมื่อ Spark อ่านข้อมูลเข้ามา จะตั้งชื่อ column เป็น _c0, _c1, _c2, _c3, _c4 โดย _c4 จะเป็น label ของชนิดของดอก iris ซึ่งกำหนดเป็น String => Iris-setosa, Iris-vesicolor, Iris-virginica ในการใช้งาน Logistic Regression ขั้นตอนต่อไป ไม่สามารถนำเข้าข้อมูลชนิด String เพื่อไปใช้งานได้ จึงต้องทำการเปลี่ยน จาก “Iris-setosa” เป็น “1” แล้วทำการเปลี่ยน “1” ซึ่งเป็น String ให้เป็น Integer ด้วย ฟังก์ชั่น cast และตั้งชื่อว่า column ว่า “label”

   จากนั้น ทำการเปลี่ยนชื่อ column _c0, _c1, _c2, _c3 เป็นชื่อตามต้องการ

   สุดท้าย ใช้ randomSplit([0.75, 0.25]) เพื่อแบ่งข้อมูลสำหรับ train 75% และ test 25%

6. ลอง แสดง Schema ดู

   df2.printSchema()

   ได้ผลดังนี้

   
   และใช้คำสั่งนี้ เพื่อดูข้อมูล

   df2.show()

   ได้ผลประมาณนี้
   

7. ใน Spark 2.x จะมี Concept ของการใช้ Pipeline เพื่อให้สามารถออกแบบการทดลอง ปรับค่า Meta Parameter ต่าง ๆ ของโมเดล และทำงานอย่างเป็นระบบยิ่งขึ้น (ในขั้นตอนนี้ ขอไม่ปรับค่าใด ๆ ก่อน)

   # Model
   assembler = VectorAssembler(
   inputCols=["sepal_length","sepal_width","petal_length","petal_width"],
   outputCol="features")
   lr = LogisticRegression()
   paramGrid = ParamGridBuilder().build()
   
   #Pipeline
   pipeline = Pipeline(stages=[assembler, lr])

   ในการใช้งาน Logistic Regression ต้องกำหนดค่า field คือ features โดยกำหนดให้มาจาก Column sepal_length, sepal_width, petal_length, petal_width ส่วน label ได้กำหนดในขั้นก่อนหน้าแล้ว

   จากนั้นสร้าง lr เป็น instant ของ LogisticRegression

   ในการปรับค่า Parameter จะมาใส่ใน ParamGridBuilder ซึ่งจะไม่กล่าวถึงในขั้นนี้

   สุดท้าย นำ assembler และ lr มาเข้าสู่ stage วิธีการนี้ทำให้การทำซ้ำขั้นตอนต่าง ๆ ใน Pipeline สะดวกยิ่งขึ้น (ต้องเห็นกระบวนการที่ซับซ้อนกว่านี้ จึงจะเห็นประโยชน์)

8.  ขั้นตอนสำคัญ  pipeline มาแล้ว ก็ต้องนำมาสร้าง model โดยการ Train ด้วยชุดข้อมูล “train”

   model = pipeline.fit(train)
   predictions = model.transform(train)

   แล้ว นำ model ที่ได้ มาทดลอง predictions ด้วย transform() บนข้อมูล train ผลที่ได้ คือ ผลการ Predict จาก Model

9. ต่อไป คือ การตรวจสอบว่า Model ที่สร้างขึ้น มีความแม่นยำแค่ไหน ในที่นี้ จะใช้ MulticlassClassificationEvaluator เพราะ label มีมากว่า 2 ชนิด

   evaluator=MulticlassClassificationEvaluator(predictionCol="prediction", labelCol="label")

   แล้วนำ เปรียบเทียบว่า สิ่งที่ predict ได้จาก model

   evaluator.evaluate(predictions)

   ถูกต้องมากน้อยขนาดไหน กับข้อมูล test

   evaluator.evaluate(model.transform(test))

10. ผลที่ได้ ประมาณนี้
    โดยจะเห็นได้ว่า มีความถูกต้อง 0.9521 … หรือ 95.21% นั่นเอง